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遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

2007-12-25 00:15迴響:9點閱:2957

 

《基因組圖譜解密》

Cracking the Genome

戴維斯(Kevin Davis)著

潘震澤譯 時報出版 2001

 

        二十世紀末科學界最轟動的大事,大概要算二○○○年的六月二十六日,由美國總統柯林頓及英國首相布萊爾以衛星連線共同宣佈:人類基因組計畫的提前完成。這項工作被推崇為:「我們得知了上帝創造生命的語言」及「二十一世紀第一件最偉大的科技勝利」。在這些華而不實的話語後頭,科學家究竟成就了什麼了不起的事呢?

 

事實上自一九九○年起整整十年間,有關人類基因組計畫的新聞,就不斷佔去了報章雜誌的頭條。一開始是許多反對的聲音,認為這項工作既花錢又沒有什麼意義;接著是許多疾病相關基因的發現,使得大眾對此計畫寄予厚望;再來是基因專利權的爭議,又將計畫染上些許銅臭味。

 

相關的新聞報導中,有好幾個人名不斷地出現,像是發現 DNA 結構的諾貝爾獎得主華生(James Watson),於一九八九年接下美國人類基因組計畫的總主持人一職,然後又在一九九二年與國家衛生院院長鬧翻辭職;華生的繼任者柯林斯(Francis Collins)也是媒體寵兒,他身穿皮夾克與夜鷹機車合影的相片,登在《時代》雜誌上,顛覆了傳統科學家的形象。

 

接著是另一位原本沒沒無聞的科學家凡特(Craig Venter),先後成立了兩家私人公司,以創新的研究方法及先進的電腦軟硬體,創造了許多「第一」的新聞。其中最驚人的是凡特於一九九八年宣稱,他將以私人公司之力,比由美、英、德、法、日等國一流基因組中心所組成的國際聯盟,還要提前好幾年時間,就完成人類全部DNA序列的定序工作。最後就是二○○○年的六月,由政治人物宣佈該計畫的完成。

 

        除了外電報導之外,有關基因組的國產新聞,也一樣熱鬧滾滾。先是由陽明大學及台北榮總所組成的團隊,將第四號染色體上千萬鹼基的序列給決定的消息,風光地登上了報紙的頭條。接著是中央研究院的李遠哲院長帶頭要求政府撥款數十億經費,成立國家基因體中心的消息,亦不遑多讓,一再見報。根據李院長的說法,這項工作是「今天不做,明天就會後悔」的事。究竟人類的基因組有何德何能,值得我們如此重視呢?

 

任何科學研究都有其歷史淵源,鮮少無中生有,人類基因組計畫亦然。如今該計畫已宣告完成,並進入所謂「後基因組時代」,我們不妨回首百年來遺傳學的發展,對於上述問題,庶幾有所了解。

 

從孟德爾到摩根

            「龍生龍,鳳生鳳,老鼠生的兒子會打洞。」中國人對於遺傳的觀念,一向深信不疑,不但認為「虎父無犬子」,同時尋求改善「品種」的努力,也深植人心。話雖如此,「將相本無種」、「歹竹生好筍」等激勵上進的說法及實例,亦所在多有,因此不免讓人尋思:先天體質與後天環境究竟何者為重?人是否必然受到遺傳的限制,難以突破?還是功不唐捐,努力必有所成?再者,某些家族成員天生受惡疾所苦,英年早逝;有些則中年以後多慢性疾病,難以終老;還有的則鮮有病痛,活至耄耋之年;這些究竟是生活習慣造成,還是遺傳使然?

 

            遺傳的問題,雖然常是一般人茶餘飯後的話題,但真正以科學方法將遺傳性狀在親子間分布,加以仔細記錄研究的,首推十九世紀後葉的孟德爾(Gregor Johann Mendel, 1822–1884)。孟德爾以豌豆的顏色及形狀等外在表徵為觀察對象,得出了兩大定律:第一是配子(精子及卵子)形成時,來自父母的對偶基因會各自分離到其中一個配子(以減數分裂形成單套體);而受精時,兩個單套的配子結合,又再形成雙套體。對偶基因有顯性與隱性之分,因此遺傳性狀也有所謂的基因型與表現型的分別。至於孟德爾的第二定律,則是指配子形成時,各種不同對偶基因的分離是獨立的(前提是這些基因位於不同的染色體上)。

 

            以後見之明來看孟德爾的發現,不單失之過簡,裡頭也多有運氣成分,但孟德爾定律卻是現代遺傳學的發軔與根本。孟德爾於一八六六年發表了他的發現,但卻遭到忽視,直至一九○○年,才同時由三位不同國家的植物學家給重新發掘出來,二十世紀也正式進入了遺傳學的世紀。遺傳學(genetics)一詞由英國劍橋大學的動物學家貝特森(William Bateson, 1861 – 1926)於一九○六年所訂,貝特森也是孟德爾理論的積極鼓吹者;而基因(gene)一詞,則是一九○九年由丹麥植物生理及遺傳學家約翰森(Wilhelm Ludvig Johannsen, 1857–1927)所訂。

 

            第一位以遺傳學研究獲得諾貝爾獎肯定的,是一八六六年出生的摩根(Thomas Hunt Morgan, 1866–1945,孟德爾發表遺傳理論的同一年),於一九三三年以研究果蠅的遺傳得獎,他也是第一位獲得諾貝爾生理醫學獎的美國人。一如當初孟德爾的豌豆研究,摩根和哥倫比亞大學一群優秀的學生以果蠅的各種外形為對象,確定了遺傳物質(基因)是由位於細胞核內的染色體所攜帶,同時他們也建立了有史以來第一份染色體上基因相關位置的圖譜。

 

遺傳物質 DNA

            摩根的研究雖然確立了染色體在遺傳上的重要性,但遺傳物質究竟為何,卻未有定論;那是因為染色體的構造裡,蛋白質及核酸各佔了一半,甚至當時主張蛋白質是遺傳物質者,還佔多數。直到一九四三年,洛克斐勒大學的艾佛瑞(Oswald Theodore Avery, 1877–1955)根據十五年前英國的格里菲斯(Frederick Griffith, 1879–1941)所發現的細菌轉型現象作進一步的研究,證實了造成細菌性狀改變的物質,是去氧核糖核酸(DNA),而非蛋白質。接下來的十年間,各方的科學家便致力於解開 DNA 的結構,最終由華生及克里克(Francis Crick, 1916–2004)拔得頭籌,於一九五三年解開了 DNA 雙螺旋結構的奧秘。

 

            自一九五三年迄今,古典的遺傳學研究大部分已為現代的分子生物學所取代。以往抽象的基因,不但可化約成特定的 DNA 序列,以及真正執行功能的基因產物——蛋白質,同時各個基因在染色體上的位置,也可以逐步標定。在實驗動物身上,研究人員更可以進行基因轉殖或基因剔除等工作,藉由操弄特定基因,以確定其生理作用。但問題是這樣的做法,對於研究人類的基因來說,卻是力有未迨。一方面是人類基因組的龐大與複雜,使得找尋任何未知基因的工作曠日費時;再來,則是操弄人類基因所面臨的道德問題。

 

人類每個體細胞都擁有二十三對染色體,裡頭的 DNA 由超過三十億個鹼基字母所組成,就算扣除大量功能不明的所謂「垃圾」DNA,裡頭帶了約三萬個基因,一半以上身分仍然未明。因此自一九八○年中葉起,就不斷有科學家提出將整個人類基因組給定序的想法,希望能一舉解決基因定位的漫長繁瑣過程。如果成功的話,不單所有人類基因的數目、位置,以及構造,都將為人所知,同時科學家也將能夠逐漸了解未知基因功能,甚至予以改造。這種偷窺天機的誘惑,就算是堅決反對「基因決定論」人士的內心深處,只怕也免不了有幾分好奇:究竟號稱萬物之靈的人類,有幾分是基因,又有幾分不是基因,可以決定的?

 

人類基因組計畫與本書內容簡介

《基因組圖譜解密》一書,即是以近十年來人類基因組定序工作的始末為經,百年來遺傳學的發展為緯,交織而成的精采報導。本書作者戴維斯本是遺傳學家,一九九○年加入著名的《自然》雜誌擔任編輯,九二年並成為新創刊的《自然遺傳學》主編。由於所學及職務之便,戴維斯不單對整個基因組研究的來龍去脈瞭如指掌,他和參與這項計畫的各路人馬也都相知相熟,兼具圈內人及觀察者的角色。因此本書不但散發內行人的權威口吻,更充斥著許多不為外人知的趣味小故事。所謂「外行看熱鬧,內行看門道」,是本書最貼切的寫照。

 

            科學發現與藝術創作的最大不同點,在於藝術創作可百花齊放,百鳥爭鳴,科學發現就只有一次機會,拔得頭籌者得享一切榮耀。歷來許多偉大的科學發現,同時都有不只一位的研究者在較勁,爭取勝利的果實。一九六八年,華生將 DNA 雙螺旋結構的發現經過,寫成了《雙螺旋》(The Double Helix)一書,其中對於科學家勾心鬥角、爭強奪勝的率直敘述,讓一般大眾驚詫不已。其實科學家是人,當然少不了人的七情六慾;科學研究既然是人類的活動,也就脫離不了種種人性的表現。不管怎麼說,除了興趣以外,優先權及專利權(亦即名與利)之爭,也是科學進步有力的推手。同樣的主題,四十多年後在凡特與柯林斯身上,再一次得到見證。

 

            本書的主軸,即圍繞在柯林斯所領導的公家人類基因組計畫,與凡特所主持的私人公司(先是泰格,後是塞勒拉),對基因組定序的優先權之爭。書中第一章重述了華生及克立克的發現,以及人類基因組計畫的源起;第三及第五章著重於凡特的工作;第四章以介紹柯林斯及其他公家單位的科學家為主。第七、九及十一章,則是雙方的「攻防紀錄」,以至於最後的「大和解」;這些章節可以連續閱讀,對本書的主題,當有一氣呵成之感。

 

至於本書的第二章,是基因組的背景知識介紹;第六章及第八章分別談及人類遺傳學及考古人類學的研究,對於疾病基因的找尋、人類起源、遷徙和演化的紀錄,以及在歷史和法醫學的應用,所扮演的角色。第十章則著重於基因組學的研究,將怎樣影響到人類的未來。這些章節對於本書主軸故事來說,雖屬旁支,但其中敘述知識性及趣味性十足,不論是想要了解人類基因組的潛力,或其限制,都不可或缺。

 

        生物科技號稱是國內下一波產業革命的主流,知識經濟的口號朝野也叫得成天價響,但一般人未必曉得基因組學的研究,對人類的過去與未來,究竟可有些什麼影響?所謂「鑑古知今」,閱讀本書對於人類基因組計畫始末的詳實記載,有心人當能從中學到許多,進而解開一二人類亙古以來的問題。

 

譯後記:本書的書名號稱將基因組「解密」(Cracking the Genome),但行內人都知道那是新聞報導及出版行銷的誇張說法;本書英國版的書名《序列》(The Sequence 則平實許多。決定了基因組的序列是一回事,至於要解開其中的秘密,則可能還需要再幾十年的時間。至於 genome 一詞指的是一個物種所有基因的組合,因此「基因組」本是合理的譯名,但目前似乎已為「基因體」所取代;為避免讀者混淆,特此說明。

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引用:http://blog.chinatimes.com/jenntser/archive/2007/12/25/229761.html
2007-12-25 00:15作者:潘震澤分類:書評書介迴響:9點閱:2957

迴響與引用列表

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

jay chang,

多年前我寫過篇短文「基因組 vs. 基因體」,我把重要的一段貼在下頭;至於你建議的「遺傳材料」則太籠統了,一般人會想到 DNA 或染色體,而不是genome。

>>Genome一詞按定義,是指生物個體單套的染色體上,所有的基因組成;因此譯成「基因組」是合理的。但拿genome的字根分析,前半來自基因(gene),後半來自染色體(chromosome),似乎譯為「基因體」也沒錯。

>>據筆者有限的觀察,「基因組」是較通用的譯名,歷史也較久;「基因體」則是陽明大學的卓越計畫所首創的名詞,使用者較少。再者,「基因體」的名稱也有誤解的可能,讓人以為基因真有個「體」的存在。因此根據先來後到、使用頻率、及合理性三原則,筆者主張繼續使用「基因組」。

2008-01-10 20:42 震澤

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

有關genome這個字的譯文,誠如你所言有基因体,基因組的譯法,筆畚認為遺傳材料可能比較貼切,因為genome是由gene及chromosome組合而成.真正所指是基因內鹽基排列順序sequence,換句話說就是組成基因的基本材料.敬請指教,謝謝.

2008-01-10 11:05 jay chang,md

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

Fair,

血液凝結是體內屬一屬二複雜的生化反應,有十幾個因子的參與;血小板確實重要,但卻不是唯一因素。

凝血反應與抗凝血反應,對身體而言,都很重要。要是血小板數量過低,身體上下會造成自發性出血,也是嚴重的毛病。

凝血反應的發生主因,是血管受傷,無論是外傷還是血管內壁的內傷 (動脈硬化斑),都在其列,也都會造成血小板凝集與活化,引發凝血反應。

Blood thinning 是通俗的說法,通常是抑制凝血反應,而不是真的把血液給弄稀了。

2007-12-27 01:58 震澤

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

Prof.Pan
Happy holiday!
Sorry, I do not have data to support
my personal presumption on HB platelet
count relationship with heart disease.
Low count of platelet(smear?) means
the component of blood is thinner than
normal. That stirs my thinking of that
cause. Theoretically speaking, Less C/T
could mean less chance to cause the
clot in the blood.
Thank you for your time.

2007-12-26 02:30 fair

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

lin,

人類基因組計畫的過程,確實因政治及金錢的介入,讓人詬病,但計畫本身仍是重要的;華而不實的,是政治人物的宣稱,而不是計畫本身。

2007-12-26 00:38 震澤

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

Fair,

過節好。

抱歉妹有回覆你先前的問題,我對B型肝炎帶原者的了解有限,故此難以回答。我在網上看到有不少資料,想必你比我還清楚。至於你說肝炎病毒對心血管系統可能還有好處一節,如能提供更多資料,我可以看看是否合理。

60 Minutes 提供的數字,確實可讓人深思。2 的 20 次方,就可達百萬之數,無論往前推,還是往下算 (每一代生兩個小孩),400 年的時間,就已十分可觀。中國人說:「五百年前是一家」,確實有道理,由此也可看出,分族群分種族,是沒有生物意義的。

2007-12-26 00:34 震澤

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

人類基因組計畫的確是華而不實的計畫 且有太多名利的追求 金錢與商業的糾葛

我比較佩服的是玉米田裡的先知麥克林托克 她的發現推翻了許多古典遺傳學的定論 可是她最後只是一個沒錢沒勢的老女人罷了
她的發現也許在未來會越來越重要 在最近的新書最ㄙㄨㄟ者生存 中有關後成遺傳學的討論就可看出
基因組本身只是單純的突變 或者會受環境的影響而影響後代? 懷孕婦女吃的垃圾食物會影響孫子的遺傳?新拉馬克主義會復活?
看來這個老女人對未來遺傳學的影響會越來越大 一個了不起的科學家總是如此 愛因斯坦就是這樣

2007-12-25 11:31 lin

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

恭喜潘教授這部落格點閱人次超過10萬之巨,足見只要有心,哪怕談的是公認冷門的生殖生理學,也能吸引企欲求知的網友。

我就是抱著如此的心情拜託潘教授討論這基因課題的,如今看見潘教授貼出這文章,卻發現自己真是孤陋寡聞,真的無知。

我在想,以中時部落格而論,能涉及科學領域者,唯此一家,果然可以好好經營,肯定會吸引更多網友的。

2007-12-25 07:54 老銀

回應: 遺傳學百年史——《基因組圖譜解密》導讀

Track up your ancestor.
f you go back 20 generations you've got over a million grandparents."
1,048,576 to be exact. That is about 400
years ago. That is I learnd from CBS 60
minutes yesterday and it has some
relation with your article.

2007-12-25 00:55 fair

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